Принцип роботи WebMoney такий: учасникам, які зареєструвалися в системі, надаються так звані єдині інтерфейси з управління своїми майновими правами, облік яких ведеться за допомогою «титульних знаків» - спеціальних розписок. Майнові права знаходяться на зберіганні у Гарантів (спеціалізованих компаній).
Вебмані підтримує кілька типів гаманців, кожен з яких має двенадцатіначний номер і префікс, що позначає відповідного Гаранта.
Вони класифікуються наступним чином:
• R-гаманець WMR - банківський чек в рублях РФ;
• Z-гаманець WMZ - подарунковий сертифікат в доларах США;
• E-гаманець WME - банківський чек в євро;
• U-гаманець WMU - електронна українська гривня
• B-гаманець WMB - електронний білоруський рубль;
• G-гаманець WMG - гаманець, одиницею обліку на якому є один грам чистого золота;
• X-гаманець WMX - новий тип гаманців, титульний знак WMX дозволяє учаснику системи передати Гаранту майнові права на публікації записів у БД bitcoin.org
Переказ грошових коштів в системі WebMoney можливий лише між власниками гаманців одного і того ж типу. Однак титульні знаки незбіжних типів можна поміняти в спеціальних обмінних сервісах. За будь-які перекази коштів, крім транзакцій між однотипними гаманцями, в системі стягується комісія 0,8%.
Для зручності роботи в системі існує спеціальне клієнтське ПЗ - WebMoney Keeper. Також безумовним плюсом системи є той факт, що учасник може створювати необмежену кількість гаманців.