З моменту запуску в квітні 2012 р «Яндекс.Діск» діяв в закритому режимі: його користувачем міг стати тільки той, хто залишив заявку на отримання місця для зберігання даних і отримав «інвайт». За цей час запрошення отримали близько 400 000 користувачів. З вересня 2012 доступ відкритий для всіх. Кожен новий користувач отримує 10 Гб для зберігання своїх файлів і може збільшити цей обсяг за рахунок запрошення нових відвідувачів.
Доступ до сховища файлів можна отримати через пошту на Yandex, за допомогою програми на комп'ютері або веб-інтерфейсі «Яндекс.Діск». Місце на Диску безкоштовно. Ви можете завантажити туди файли окремо або відразу перемістити цілої папкою. Інформація буде зберігатися там до тих, пір поки ви самі не видалите її. Під час завантаження дані перевіряються антивірусом Dr. Web. Файли у вашій папці на «Яндекс.Діск» завжди синхронізуються: якщо ви справили які-небудь зміни в них, то вони будуть відображені в веб-інтерфейсі або при доступі через інші комп'ютери.
Досить зручно користуватися сервісом зі свого комп'ютера. Для доступу до нього досить встановити спеціальну програму-клієнт. Вона створить на вашому комп'ютері папку, і поміщені в неї файли будуть зберігатися в "хмарі".
Використання сховища даних можливо і за допомогою мобільних пристроїв. Нещодавно в Google Play і App Store стало доступно для скачування додаток «Яндекс.Діск» для Android і iOS. Після його установки та авторизації на ресурсі можна буде переглядати збережені на сервері папки на своєму телефоні або відправити туди файли.
Будь збереженої «Яндекс.Діск» інформацією можна поділитися з іншими користувачами. Для цього спочатку потрібно дозволити публічний доступ до файлів. Потім за наданою вами посиланням користувач зможе завантажити дані. Система попросить ввести нескладний 6-значний цифровий код з картинки, і, якщо він введений правильно, через кілька секунд почнеться завантаження.